Caii au 7 grupe sanguine principale și peste 30 de tipuri de sânge diferite.

Sistemul de grupe sanguine la cai a fost clasificat oficial de Societatea Internațională de Genetică Animală (ISAG). Cele șapte sisteme recunoscute internațional sunt A, C, D, K, P, Q și U. Acestea se bazează pe prezența unor antigeni specifici pe suprafața globulelor roșii. Deoarece există peste 30 de factori antigenici diferiți, numărul total de combinații posibile de tipuri de sânge este de ordinul sutelor de mii.Spre deosebire de oameni, care au anticorpi naturali (precum anti-A sau anti-B), caii nu se nasc cu anticorpi împotriva altor grupe sanguine. Acești anticorpi se dezvoltă doar după o expunere anterioară la sânge străin, cum ar fi o transfuzie sau în timpul gestației la iepe. Acest fenomen explică de ce o primă transfuzie de urgență poate fi efectuată fără un test de compatibilitate prealabil, deși riscurile rămân prezente.O problemă medicală majoră legată de aceste grupe este Izoeritriza Neonatală Equină. Aceasta apare atunci când un mânz moștenește un tip de sânge de la armăsar care este incompatibil cu cel al iepei. Iapa produce anticorpi care ajung în colostru, iar după ce mânzul suge, acești anticorpi îi atacă propriile globule roșii. Această afecțiune poate fi fatală în primele 48-72 de ore de viață dacă nu este tratată rapid prin transfuzii de sânge compatibil.