Genomul roșiei a fost descifrat complet în 2012, dezvăluind secretele gustului și ale rezistenței sale naturale.

Proiectul Internațional de Secvențiere a Genomului Roșiei (Tomato Genome Consortium) a publicat rezultatele finale în revista Nature pe 31 mai 2012. Această colaborare masivă a implicat peste 300 de oameni de știință din 14 țări diferite, inclusiv Statele Unite, China și state membre ale Uniunii Europene.Echipa a secvențiat genomul soiului 'Heinz 1706', descoperind că acesta conține aproximativ 35.000 de gene distribuite pe 12 cromozomi. Această cifră este semnificativ mai mare decât numărul de gene din genomul uman, care este estimat la aproximativ 20.000-25.000 de gene codificatoare de proteine.Cercetarea a evidențiat faptul că genomul roșiei a trecut prin două triplicări complete în urmă cu aproximativ 60 și 120 de milioane de ani. Aceste evenimente genetice au permis evoluția unor trăsături noi, cum ar fi textura cărnoasă a fructului și mecanismele complexe de coacere care fac roșiile atât de populare astăzi.Prin compararea genomului roșiei domestice (Solanum lycopersicum) cu cel al rudei sale sălbatice (Solanum pimpinellifolium), experții pot acum să reintroducă gene de aromă pierdute în timpul procesului de industrializare. Acest lucru este esențial pentru fermieri, deoarece oferă soluții biologice împotriva agenților patogeni precum Pseudomonas syringae, fără a recurge la substanțe chimice agresive.