Το γιαούρτι είναι πιο εύπεπτο από το γάλα επειδή τα βακτήριά του έχουν ήδη διασπάσει μεγάλο μέρος της λακτόζης.

Η διαδικασία παραγωγής του γιαουρτιού βασίζεται στη δράση δύο συγκεκριμένων βακτηρίων: του Lactobacillus bulgaricus και του Streptococcus thermophilus. Αυτές οι καλλιέργειες παράγουν το ένζυμο β-γαλακτοσιδάση, το οποίο διασπά τη λακτόζη σε γλυκόζη και γαλακτόζη κατά τη διάρκεια της επώασης. Μελέτες έχουν δείξει ότι το γιαούρτι περιέχει περίπου 25% έως 50% λιγότερη λακτόζη σε σύγκριση με το απλό πλήρες γάλα.Σύμφωνα με την Ευρωπαϊκή Αρχή για την Ασφάλεια των Τροφίμων (EFSA), οι ζωντανές καλλιέργειες στο γιαούρτι βελτιώνουν την πέψη της λακτόζης σε άτομα που δυσκολεύονται να την αφομοιώσουν. Αυτό συμβαίνει επειδή τα βακτήρια επιβιώνουν από τα οξέα του στομάχου και απελευθερώνουν τα ένζυμά τους απευθείας στο λεπτό έντερο. Εκεί, συνεχίζουν να διασπούν τη λακτόζη που έχει απομείνει, βοηθώντας τον οργανισμό στη διαδικασία της πέψης.Ιστορικά, η ανακάλυψη του ρόλου των βακτηρίων στο γιαούρτι έγινε από τον νομπελίστα Ilya Mechnikov στο Ινστιτούτο Παστέρ στις αρχές του 20ού αιώνα. Ο Mechnikov παρατήρησε ότι οι πληθυσμοί στη Βουλγαρία που κατανάλωναν μεγάλες ποσότητες γιαουρτιού είχαν εξαιρετικά υψηλό προσδόκιμο ζωής. Σήμερα, η σύγχρονη γαστρεντερολογία επιβεβαιώνει ότι η ημι-στερεά μορφή του γιαουρτιού επιβραδύνει τη γαστρική κένωση, δίνοντας περισσότερο χρόνο στα ένζυμα να δράσουν αποτελεσματικά.