Le génome de la tomate a été entièrement décrypté en 2012, révélant les secrets de son goût et de sa robustesse.

Le séquençage complet du génome de la tomate (Solanum lycopersicum) a été publié en mai 2012 dans la revue scientifique Nature. Ce travail colossal est le fruit du Tomato Genome Consortium, regroupant plus de 300 scientifiques issus de 14 pays différents, dont la France, les États-Unis et la Chine.Les chercheurs ont découvert que la tomate possède environ 35 000 gènes répartis sur 12 chromosomes. Ce chiffre est supérieur au nombre de gènes humains, ce qui souligne la complexité biologique de cette plante. L'étude a révélé que le génome de la tomate a subi deux triplications complètes au cours de son évolution, il y a environ 60 et 120 millions d'années.Ces événements génétiques ont permis l'émergence de nouvelles fonctions, comme la synthèse de lycopène pour la couleur rouge ou des gènes spécifiques pour la maturation du fruit. En comparant la tomate domestique avec son ancêtre sauvage, Solanum pimpinellifolium, les scientifiques ont identifié les gènes perdus lors de la domestication, notamment ceux liés à l'arôme intense.Grâce à ces données, les sélectionneurs peuvent désormais utiliser la sélection assistée par marqueurs pour réintroduire des gènes de saveur sans compromettre le rendement. Cette méthode permet d'obtenir des fruits plus résistants au mildiou ou aux pucerons tout en réduisant l'usage de fongicides.