Емпайър Стейт Билдинг е ударян от мълнии средно 25 пъти годишно.

Емпайър Стейт Билдинг се издига на 443 метра до върха на антената си, което го прави една от най-изложените на мълнии структури в Ню Йорк. Според данните на Националната метеорологична служба на САЩ, сградата понася средно между 20 и 25 удара от мълнии всяка година. През 30-те години на миналия век компанията General Electric е използвала сградата като лаборатория за изследване на мълниите.Защитната система на небостъргача разчита на принципа на Фарадеевия кафез и масивна стоманена рамка, която провежда електричеството далеч от обитателите. На върха е монтиран специален меден гръмоотвод, свързан директно със заземителната мрежа на сградата. Когато мълния удари, електрическият ток преминава през външната конструкция и се разсейва в почвата под Манхатън без да причинява щети на интериора или електронните системи.Интересен факт е, че Емпайър Стейт Билдинг често генерира т.нар. „възходящи мълнии", които започват от върха на сградата и се движат нагоре към облаците. Това се случва поради натрупването на силно електрическо поле около острите ръбове на антената по време на гръмотевична буря. Рекордът за най-интензивна активност е регистриран по време на буря, при която сградата е поразена 8 пъти в рамките на по-малко от половин час.