Фагоцитите са имунни клетки, които открояват и унищожават вредните бактерии чрез процес на поглъщане и разграждане.

Процесът на фагоцитоза е открит за първи път от руския биолог Иля Мечников през 1882 г. Докато работи в Месина, той наблюдава как специализирани клетки в морските звезди поглъщат чужди частици. За това фундаментално откритие Мечников получава Нобелова награда за физиология или медицина през 1908 г.Основните видове фагоцити в човешкото тяло са неутрофилите и макрофагите. Неутрофилите са най-многобройните бели кръвни клетки и обикновено са първите, които пристигат на място на инфекцията. Макрофагите са по-големи и способни да поглътнат значително количество бактерии или клетъчни остатъци.Механизмът на действие се основава на разпознаване на молекулярни модели, характерни за патогените. След като фагоцитът се свърже с бактерията, я обгръща със своята мембрана, създавайки мехурче, наречено фагозома. Фагозомата се слива с лизозома, която съдържа над 60 различни вида храносмилателни ензими и токсични кислородни радикали.Тази „химическа атака" унищожава микроба в рамките на минути. Фагоцитозата е критична част от вродения имунитет и служи като първа линия на защита срещу патогени. Без тези клетки дори леки инфекции биха могли да станат фатални за човешкия организъм.